李岚称，转植酸酶基因玉米并非最终生产应用的品种。在获得安全证书之后，首要工作就是要推进杂交品种选育。“如果新品种获得安全证书，可以参照品种认定程序执行，但是相关部门并未将常规作物的品种申（认）定的做法和转基因作物品种的审定接轨，而且衍生品种申请并没有获得安全证书，因此没有机会进入品种审定程序。”
华中农业大学教授张启发也认为，转基因水稻产业化最大的阻力在于政府无决策。他在2013年曾对媒体说，2009年曾有两个品种的转基因水稻获得农业部安全证书，因外界反对声音，农业部并没有为其建立一套程序，一套如何评审转基因水稻商业化推进的办法。
事实上，转基因主粮是不能参加区域试验的。相关法律及文件明确，“要对参加区域试验的水稻、玉米、油菜、大豆等品种进行转基因成分检测，一经发现，立即终止试验并按照《办法》等规定严肃处理。”
张颛称，目前安全证书到期的转基因水稻、玉米无法通过品种审定，因为通过首先需要在增产、抗逆性等方面达到相关标准。
张启发也曾抱怨过这种品种审定制度。“中国品种审定过分强调增产，不增产就不给发证书。”
转基因棉花“突击”商业化
舆论争议转基因主粮商业化之时，官方宣布，中国此前已经批准并实现商业化的转基因品种只有棉花、番木瓜。因为毕竟不是主粮，棉花、番木瓜转基因产品的争议相对较小。
当然，对于棉花来讲，批准商业化有其时代背景。1990年代，中国大部分棉产区遭遇棉铃虫灾害，遭受严重损失。从1991年起，转基因抗虫棉研究正式启动。1997年，在政府的支持下，我国正式批准转基因抗虫棉商业化生产。
可是，涉及转基因生物安全的《条例》于2001年5月才正式公布并施行。
张颛称，作为特例，转基因棉花的商业化路径对水稻、玉米来讲并没有参考价值。
作为坚定的挺“转”人士，李岚称，尽管我国多地农村还有食用棉子油的习惯，但是在大多数人的意识里，棉花是非食用作物，主要使用其纤维。
除此以外，舆论环境也日益复杂。李岚说，当然，争论转基因是否安全，这种讨论本身无害，但是反“转”人士造谣生事所导致的负面影响却难以消除，从而也影响到决策部门和决策者。
记者多次致电转基因番木瓜团队负责人，试图联系对方，但是对方均因担心当前舆论场观点多元予以拒绝。
未来转基因玉米成科研方向
今年6月，农业部发布《转基因重大专项2015年度课题申报指南》（下称《指南》），《指南》有两个方向，即抗虫转基因玉米产业化研究、转基因产品风险交流及评估技术研究。申报还要求“申报内容必须在指南范围之内，超出范围的不予受理”。
换句话说，农业部发布的这个《指南》无疑也意味着转基因玉米将是未来科研的主要方向。
根据《指南》，抗虫转基因玉米产业化研究的经费安排是，“每个课题中央财政经费不超过5000万元，申报单位需按1∶3提供配套资金。”也就意味着，一旦项目申请成功，每个课题将最多获得2亿的科研经费。
机构研究人士表示，伴随城镇居民对肉食的消费不断增加，主要用于饲料的玉米需求也随之大增。农业部想要用转基因的技术来增加产量，还要达到保护环境的目的。
除此以外，考虑到水稻主要用于食用，因此转基因水稻推进遭遇较大阻力。但是从主要作为饲料作物的玉米着手的话，遭受的非议就会少一些。上述机构研究人员称，因此农业部转基因研究的重点开始转向玉米。
