贵州某地李先生经常直接将购买的粪肥作为基肥使用到大棚土壤中，经过夏季高温闷棚后，再种植蔬菜，由于连年重茬，土传病害严重，经常发生小苗烧根，出现肥害的情况。
种植大棚蔬菜，每年都有因为农家肥尚未腐熟施入土壤中而出现烧根、熏苗的情况，畜禽粪便发酵后是一种比较优质的有机肥，养分含量很丰富，如果不被处理或腐熟不好就直接施用到作物上，会危害到农作物的生长。
一、传染病虫害
粪便中含有大肠菌、线虫等病菌和害虫，直接使用会导致病虫害的传播、作物发病，对食用农产品的人体健康也会产生影响。未腐熟的有机物料在土壤中发酵时，会滋生病菌与虫害，容易引起植物根结线虫病，一个个像小瘤子的东西堆积在根部，“劫走”了根部的营养，阻碍了水分、养分的运输，使果树由壮变弱，最后根腐而亡。
二、发酵烧苗
不发酵的生粪等有机物料施到地里后，当发酵条件具备时，在微生物的活动下会进行发酵。当发酵部位距根部较近且作物植株较小时，发酵产生的热量会影响作物生长，烧毁作物根系，严重时会导致植株死亡。
三、毒气危害
在畜禽粪便分解过程中，会产生甲烷、氨气等有害气体，会导致土壤酸化和作物根系损伤，尤其在棚室内，危害会更加严重。
四、土壤缺氧
有机质在分解过程中消耗土壤中的氧气，使土壤暂时性的处于缺氧状态，会使作物生长受到抑制。
五、肥效缓慢
未发酵腐熟的有机肥料中养分多为有机态或缓效态，不能被作物直接吸收利用，只有分解转化成速效态才能被作物吸收利用，所以未发酵的畜禽粪便直接施用时肥效会减慢。
因此，种植户在使用畜禽粪便前，必须经过充分的腐熟后再使用，这样才能提高肥效，减少不必要的损失。
