棚室的环境相对封闭，长期没有雨水淋洗土壤，使得肥料不能随雨水淋溶到土壤深层，而残留在耕作层。同时，棚室内温度高，土壤水分蒸发量大，又会使土壤深层的盐分上升到表层。这个缓慢变化的过程称为土壤酸化和盐渍化趋势。土壤酸化和盐溃化使棚室蔬菜的出苗不齐，产量下降，品质变差。
棚室土壤改良的时机应选在春种前和秋净地后进行，两茬栽培的应在换茬间净地时的空当进行。
土壤酸化的改良措施
①正确选择肥料。改变盲目施用肥料现象，按需供给，既保证产量，又利于品质，还可降低成本，更重要的是保证了蔬菜食用安全和持续性耕作。
②推广施用腐熟生物有机肥。如施用充分腐熟的鸡粪，还可以选择秸秆生物反应堆改良土壤。
③覆土和换土。如果蔬菜大棚土壤退化严重，可对土壤实行深翻，将退化土壤深埋，或者将表层土壤挖走更换清洁土壤。
④施用改良剂。
土壤盐渍化的改良措施
①调整温室大棚的各种类肥料施用量。增加有机肥比例，降低化肥等无机元素的施用比例，施肥量应根据植株具体生长需要来设置，不能过量施肥，而且可以采取多次少量的施肥办法，一方面增加了化肥的利用率，另一方面也防止了盐渍化现象的发生。
②如果土壤盐渍化现象已发生，就施加土壤改良肥，可适量反应掉一些无机元素，防止土壤盐渍化现象的恶化和蔓延。
③在选择蔬菜品种时选择耐盐性的蔬菜，有些产品对盐分含量不敏感，不会影响产量。
