采用重施基肥，早施追肥，基肥与追肥相结合的施肥方法。一般把全部施肥量的2/3作基肥，1/3作追肥。在起垄栽烟地区，基肥分两次使用，起垄时2/3施于垄底，另外的1/3在移栽时施于窝内。追肥一般在栽烟后20-30天时进行。有机肥与磷、钾肥一般作基肥施用。一般亩施有机肥3000千克，过磷酸钙30千克，硫酸钾20千克，或在施有机肥的基础上，施不含氯的三元复合肥40千克。追肥以氮肥为主，一般亩施尿素10-15千克。生产上推广的双层施肥法是在起垄前将基肥用量的60%-70%条施于烟株栽植行的底部，尔后起垄，移栽时再把剩余的肥料施于定植穴底部，两层肥料之间用10厘米左右的土层隔开。双层施肥应提高基肥的比例，甚至只用基肥，不追肥。
叶面追肥是烟草生产上常用的方法。若植株表现缺氮、磷、钾肥时，可直接喷洒0.5%-1%的尿素和磷酸二氢钾水溶液，于打顶后喷一次，浓度为1000倍液，10-15天后再喷一次。烟草是忌氯作物，生产上不能大量的施用氯化钾或含氯复合肥料，以免影响烟叶品质。
