一，输液法 此法具有节省肥料、肥效迅速、清洁卫生、方法简便等特点。此法适用于果树追施液体肥料，在缺素植株树干的一侧打洞至木质部，将注射针头插入，针头通过胶管链接装有相当于叶面喷施适宜浓度肥液的小瓶，将瓶捆绑在概予注射部位的树干上，利用虹吸原理，待溶液树体内。一般宜在生长旺盛时间进行，以促进生长，有时也可在休眠期进行，以提高植株抗寒性，使其安全越冬。
二，打洞填埋法 打洞填埋法适于果树等木本作物施用液体微生物肥料。在果树主干上打洞，待固体肥料填埋与洞中，然后封闭洞口。
三，涂抹法 涂抹法适用于果树作物施用液体生物肥料，在萌芽后，用相当于冲面喷施浓度20倍的肥业涂抹1年生枝条2次，相隔10-15天，不要沾到叶子上，效果更好。
菜田施肥主要有两种方法：基肥和追肥。基肥主要用来满足蔬菜整个生长期间或苗期对养分的需求，一般分底肥和种肥；追肥是根据蔬菜的生长特点、土壤的供肥情况而采取的分次追施的一种施肥方法，目的是为了满足蔬菜哥哥生育时期对各种养分的需求，一般要适时、适量、追肥分根部追肥和根外追肥。其中微生物菌肥中的放线菌菌肥可作基肥、追肥、浸种、拌种用。瓜类、白菜作物可作追肥，或用500g放线菌菌肥钾1.5--3KG水，作浸种、拌种用。根据肥料的性质、蔬菜的生理需求、蔬菜的不同生育期、气候状况与菜田肥力等情况来确定施肥的种类、方法和用量。
