环境保护有两种方式，即主动保护与被动保护。腐植酸类磷肥是发展绿色食品的有效途径之一，绿色食品开发是将保护环境与发展经济有机结合的主动保护的典范，它将环境作为一种生产要素加以培育和利用，通过产品载体进入市场，实现其价值。绿色食品生产避免或最大程度地限制化学合成肥料、化学农药、植物生产调节剂等的使用；大量使用有机肥、复合肥、生物肥等。这样就可以避免大量的农药、磷肥等有害物质残留于土壤中，可防治土壤板结，减轻土壤中有机质的退化程度，保护生态环境和资源。同时，开发绿色食品必须对原料产地的水、土、气等环境要素进行监测，根据监测结果，采取有效的防治措施，以保证其原料产地的环境质量。
按规定要求，绿色食品生产基地及周围环境，不准产生新的污染源;即使有少量不可避免的老污染源，也必须进行“三废”治理。开发活化这部分被固定的磷素资源，将对我国农业发展具有重大的现实意义。腐植酸土壤改良剂就是很好的土壤磷素活化剂。
磷肥过量使用或使用不当造成了土壤污染和水体富营养，含磷化合物的施用与排放严重破坏了磷的自然循环和社会代谢，造成环境污染，其中水圈与生物圈受磷的影响最为明显。磷对水体富营养化作用起关键作用因素。
