与传统合成的无机和有机化肥农药相比，生物农药具有自身的特点，具体表现在以下方面:
一，生物农药活性高、用量少，对哺乳动物毒性较低，施用后对人、畜比较安全。
生物农药中的活体生物（包括微生物）、信息素等对靶标等有明显的选择性，乃至专一性，因而基本上不对哺乳动物构成威胁。
二，防治范围相对较小，因而具有明显的选择性。
大多数生物农药，特别是昆虫天敌、活体微生物以及昆虫信息素对靶标有明显的选择性，有时甚至表现为专一性，即只对部分靶标生物有效，而大多数杀虫剂具有广谱活性，会影响有机体如鸟类和昆虫以及哺乳动物。
三，对环境污染较轻，对非靶标生物比较安全。
生物农药用于防治害虫时表现出用量少、分解快，从而避免了环境遭受严重污染，这是因为生物农药中的活体生物本身就是自然环境存在的生物体。这些生物体死亡后很快就被其他微生物分解，不可能对环境产生不利影响。
四，对靶标生物作用缓慢。
和传统化学农药作用的速效性相比，大多数生物农药尤其是活体微生物及某些植物提取物和抗生素对靶标生物作用缓慢。
五，可以导致害虫致病。
一些生物农药品种，具有在害虫群体中的水平或经卵垂直传播、导致害虫致病的能力，在野外一定的条件下，这些生物制剂具有繁殖、扩散和发展流行的能力。不但可以对当年当代的有害生物发挥控制作用，而且对后代或者翌年的有害生物种群起到一定的抑制，具有明显的后效作用。
六，可利用农副产品生产加工。
目前国内生产加工生物农药，一般主要利用天然可再生资源（如糖厂的甘蔗渣、农副产品的玉米、豆饼、鱼粉、麦麸或耨写植物体等）原材料，来源十分广泛、生产成本比较低廉。因此，生产生物农药不会与化工合成产品争夺原材料。
