常用于盐碱土壤改良的调理剂主要有化学改良剂、微生物改良剂、烟气脱硫废弃物、有机肥、腐植酸、沸石几类，其中微生物改良剂和有机肥的施用风险与酸性土壤改良剂类似，故本节主要针对其他几种盐碱土壤改良剂的施用风险进行总结。
化学改良剂
应用于盐碱土壤改良的无机化学改良剂主要分为两类：一类是含钙物质，即直接钙作用剂，包括石膏、磷石膏、煤矸石、粉煤灰等;另一类是酸性物质，即钙有效化剂，包括硫磺、硫酸、磷酸、盐酸、硫酸铁、硫酸铝等。在盐碱土壤中长期大量使用磷石膏可能会带来一些安全风险，主要体现在重金属污染、氟化物污染、放射性元素污染、含磷化合物污染几个方面。王小彬等通过分析中国磷石膏的相关统计数据表明，磷石膏中汞、镉、砷、铬、铅、镍、铍元素含量较相关土壤和地下水标准均有一定程度的超标，存在土壤和水体污染风险。磷矿石中的氟会进入磷石膏，其中全氟和水溶氟含量同样超过相关标准，存在土壤和水体氟污染风险。磷矿石中约80%的放射性元素镭226残留在磷石膏中，可被作物吸收或累积，对人类健康具有潜在威胁。磷石膏中的含磷化合物可能会随雨水而浸出，存在地下水污染的风险。长期施用煤矸石与粉煤灰可能会导致土壤重金属污染，原因是这类材料本身含有的重金属元素难以去除。硫磺、硫酸、盐酸、磷酸等钙有效剂要注意适量施用，长期大量施用可能会导致土壤过度酸化而不能达到良好的调理效果，另外硫酸铝单独施用不利于土壤结构的改善，还需要与其他改良措施配合使用。
烟气脱硫废弃物
烟气脱硫废弃物的理化性质与天然石膏接近，利用Ca2+置换出土壤胶体中的Na+、Mg2+，进而降低盐碱土壤对植物造成的危害弃物对土壤造成的影响与磷石膏类似。长期施用烟气脱硫废物，可以从以下几方面考虑：烟气脱硫废弃物中的汞、镉、砷、铅、镍、铬元素含量较高，长期施用可能会造成土壤和地下水的重金属污染;高量的硒元素可能产生硒元素的安全问题;高量的氟污染物可能会进入农田土壤并渗入地下水，存在土壤和水体的氟污染风险。除此之外，高量的Cl-易导致地下水的Cl-污染。
腐植酸
腐植酸能够中和土壤碱性、增加土壤有机质，因此也常配合其他土壤调理剂应用于盐碱土壤改良。目前鲜有研究报道长期施用腐植酸对土壤造成的负面影响，多为正面的积极效应。但也有研究称，腐植酸可与水体中的许多离子发生交换或络合作用，增强某些微污染物的溶解度，增强其迁移能力。因此，腐植酸的施用可能会对水体造成污染，给水体环境及人体健康带来隐患。另外，在饮用水消毒的过程中会产生氯气，氯气与水中的腐植酸发生反应生成三卤甲烷(THMs)和卤乙酸(HAAs)等，这类卤化副产物对人体具有致癌作用。
因此应进一步探讨研究腐植酸是否会对地下水造成污染带来环境隐患与风险，在盐碱土壤改良工作中应充分考虑腐植酸的用时用量问题。
沸石
针对施用沸石对土壤环境造成负面影响的研究报道较为少见，但有研究称4A沸石应用于实际的盐碱土壤改良时，虽然具有较强的Ca2+交换能力，但是可能由于沸石颗粒过细，会加剧土壤的板结程度，因此应用4A沸石改良盐碱土壤可能会存在一些负面影响。故选用沸石材料进行盐碱土壤改良时应选择合适的粒径规格，防止土壤板结现象发生而影响土壤修复效果。另外，研究表明沸石可能会对人体的某些细胞产生毒性，并且可能具有致癌性，因此施用沸石过程中应做适当的防护措施以避免对人体健康造成损伤。
