大量施用化肥
长期使用大量化肥，造成土壤肥力下降，有机质含量下降。导致土壤团粒结构遭到破坏，通透性差，土温低，影响根系生长。化肥中的氮、磷、钾大量进入土壤后，引起土壤板结。过量的氮磷钾以及其他营养元素的投入会引起作物根系生长受阻，生长缓慢，植株矮小、瘦弱，叶片黄绿、小而薄。
过度使用农药
使用农药对土壤的污染是比较大的。尤其是一些高毒农药以及残留期比较长的农药和除草剂。有些农药对于作物来说是有毒的，有可能导致作物中毒或者死亡。所以在使用农药时一定要遵循国家规定的安全间隔期和严格的使用方法。
施肥不当
土壤中营养元素的比例是相对固定的，而作物生长所需营养元素是动态变化的。所以在作物生长期对肥料需求不大时，可以减少施肥量;而当作物进入生殖生长阶段后，需肥量大大增加，如果不及时补充养分的话，就会造成土壤养分失衡。
过量施用氮肥可使植物出现叶厚、叶片小、叶色浓绿、植物高度矮等症状。过量施用氮肥还会使作物生长过快而出现徒长现象。
偏施碱性肥料
偏施酸性肥料和碱性肥料会使作物叶片变黄变薄;土壤酸化还会影响作物对其他营养元素的吸收，使养分流失严重等问题;土壤酸化还会破坏土壤团粒结构，降低土壤肥力。
有机质缺乏
由于长期施用化肥导致大量有机质被带走或减少，造成土壤团粒结构被破坏。
