在自然界中微生物无处不在，而土壤是它们的大本营，也是它们生长和繁殖的天然“培养基”。
土壤微生物是土壤中我们肉眼难以看得见的所有微小生物的总称，主要包括细菌、真菌、放线菌和藻类等。它们是土壤的重要组成成分，但个体微小，一般以微米或毫微米来计算。
在土壤中微生物的数量和种类惊人，1克土壤中能有几亿到几百亿个微生物，种类也有数千乃至数万种。其中细菌最多，放线菌、真菌次之，藻类较少。它们在土壤的数量和种类是会根据土壤环境而不断变化的。
土壤微生物对土壤的形成发育、物质循环和植物生长等都十分重要。可以说是土壤能够生产产品、净化水源，并成为最有效的二氧化碳封存场所的根本。和我们人类一样，微生物为了生存和保持健康的身体，也需要不断地从外界环境中获取食物。
我们人类的食物都是按食物名称来称呼的，比如大米、西红柿、牛肉等等。而微生物的食物主要是根据在它们身体里的生理作用来分类，如碳源、氮源、生长因子、水等。微生物经常食用的碳源物质主要有糖类、有机酸、二氧化碳、蛋白质等。
而能被它们利用的氮源物质主要包括蛋白质及其降解产物、铵盐、硝酸盐、分子氮、脲、胺、酰胺等。
除此之外，微生物还需要食用维生素、氨基酸、嘌呤和嘧啶等来满足自身生长的需要。
无机盐也是微生物生长所需的物质，一般有磷酸盐、硫酸盐以及含有钠、钾、钙、镁、铁等元素的化合物。
水也是微生物生长的关键一环，主要是起到溶剂与运输介质的作用，不仅如此，水还能参与其细胞内一系列化学反应。
