一，施用有机肥重要的一点是增加土壤中的有机质。它是土壤肥力的主要物质基础。有机肥对土壤结构、养分、能量、酶、水分、通风和微生物活动有重要的影响。
二，有机肥含有大量植物所需的养分，对植物的养分供应相对温和有很长的后效。由于有机肥中的各种营养成分，有机肥还含有多种微量元素，为生产高产、无公害的绿色食品提供了条件。有机肥增加了土壤中各种糖类含量有了糖类，有了有机物在降解中释放大量的能量，土壤微生物的生长、发育和繁殖都有能量。
三，施用有机肥大大提高了土壤酶活性。畜禽粪便中带有动物消化道分泌的各种活性酶，以及微生物产生的各种酶，这些酶有利于提高土壤的吸收性能，缓冲性能和抗逆性能。施用有机肥增加了土壤中的有机胶体，并使土壤颗粒胶结。成为稳定的团粒结构，改良土壤的物理、化学和生物特性，改良土壤保水性、保肥性和透气性。为植物生长创造良好的土壤环境。
四，有机肥在土壤中分解转化成各种腐殖酸物质。腐植酸物质可以促进植物体内的酶活性、物质合成、运输和积累。腐植酸是一种高分子物质，具有阳离子代换量高，络合吸附性能好，对重金属离子的络合吸附作用。能有效减轻重金属离子对作物的毒性，阻止其进入植物体内。
