近几年来，晚稻生育后期出现了一些非正常现象，使农民一筹莫展，值得引起重视。
抽穗不整齐。
主要反映在两系杂交稻，可能引起抽穗不整齐的原因较多，如品质纯度不高、环境条件包括使用农药等影响。不同原因引起晚稻抽穗不整齐的表现也不尽相同，应根据田间表现以及晚稻生长期管理、天气因素具体分析，有利于找出真正原因。一般在晚稻不同生育期气温过高，会造成不同的一些异常状况。秧田期容易提早进入穗发育阶段，部分植株可能早抽穗，一般植株较矮，穗形较小，而部分晚稻生育期正常或略提早，因而会出现抽穗不整齐的情况，而在大田期特别是孕穗期后出现高温天气，一般不会引起抽穗不整齐，主要表现为颖花退化加重，出现结实率下降等现象。
目前，生产上使用的两系杂交稻品种，制种时使用的母本大多为光温敏雄性不育材料，其育性容易受温度的影响。制种过程中，母本在孕穗期至抽穗期温度适宜或较高时，表现为雄性不育，需由父本传粉完成受精过程，所结的种子为两系杂交种；而在孕穗至抽穗期若温度过低时，部分母本或母本上的部分颖花育性恢复，表现为雄性可育，出现自交结实现象，不需要由父本传粉完成受精过程，所结的种子遗传性与母本相同，制成的种子纯度下降，其中有两系杂交种，也有与母本性状相同的种子。母本自交结实引起种子纯度下降，其中有两系杂交种，也有与母本性状相同的种子。母本自交结实引起种子纯度大幅度下降，含有母本自交结实种的两系杂交种种入大田后，田间部分单株为两系杂交稻，部分单株性状与母本相同，会出现明显的抽穗不整齐现象。
颖壳出现褐斑。
主要反映在部分晚稻颖壳有褐色斑点，颜色发暗，影响晚稻的商品性。造成这种情况，一般认为有以下几点原因：一是施氮过量对色泽影响最大。减少氮肥用量，适当增施磷钾肥，能减少稻谷褐壳，同时也有利于提高稻米的品质和产量。氮肥施得过多，植株变得柔弱多汁，易倒伏和发生病虫害，后期灌浆速度变慢而贪青迟熟，导致晚稻颖壳灰暗色。二是谷枯病可造成稻穗上大量籽粒变褐色，这种病菌在谷粒上越冬，水稻抽穗后侵害花器和幼颖，以后渐发展为边缘不清晰的圆斑，后病斑融合为大斑，使谷粒呈褐斑。三是受稻飞虱的危害影响，晚稻生长后期稻飞虱爬到稻穗上取食，数量大时其分泌物使稻株谷粒污染变褐色。
水稻颖壳张开不灌浆。
一般在8月下旬期间，晚稻颖壳张开，但不闭合，不扬花不灌浆，一般成片发生，病穗率一般10%左右，严重的超过50%，对晚稻生产影响较大。造成颖壳张开不灌浆的原因复杂，但一般认为其主要原因是：一是晚稻在穗分化发育期遇到异常高温、异常低温、雨涝等情况，或者受到一些药物的影响和刺激，会出现颖壳畸形，结实不良等现象。特别在抽穗时，如果日平均气温低于20℃，或日最低气温小于17℃，可造成谷粒畸形和形成空壳，或者不良施用多效唑或二甲四氯等激素型除草剂，尤其是在晚稻拔节后施药、过量施药，也会引起颖壳畸形而不灌浆。二是与土壤因素有关。因为一些地方发生这种状况后，一般会在这些地方年年发生，可能与土壤因素有关，但究竟是缺少某些营养元素，还是其他有毒物中毒，目前还不太清楚。这种田对杂交籼稻危害大，而对粳稻不明显。三是砷中毒可能致晚稻颖壳张开而不灌浆。据了解，砷中毒可能导致水稻开花后出现重颖（双颖），颖壳畸形，关闭不拢，弯曲得像鸟嘴，颖壳之内很少结实，即使结实也只有很短的青粒米，不成熟。“旱改水”的田块发生较多，造成水稻颖壳畸形、重颖、不结实的主要原因，是长期旱作的田块改种水稻后，土壤中的砷富集到表层土壤，特别是长期种植高产蔬菜，造成硫元素相对不足，硫、砷比例失调，引起水稻砷中毒。以前种植黄瓜、豇豆、韭菜的田，硫元素消耗多，砷元素相对富集，改种水稻后更易发生中毒现象。大田四周有沟系，硫元素多而砷元素相对少，水稻中毒较轻。
防治晚稻后期的这些异常现象，首先在用种时，应选用纯度高的两系杂交种。其次是合理施用，特别是氮肥施用不能过量，注意磷钾肥配合施用；合理确定晚稻的播插期，避免晚稻生育后期的低温影响，注意防治后期的飞虱危害而造成褐斑的形成。最后是防止砷中毒。常年发生砷中毒的田块宜改种蔬菜，玉米、甘薯等秋熟作物，不宜种水稻，趋利避害。
