西红柿施菌肥可防治各种病害，施菌肥防病害和施农药杀菌剂还是有一定的原则的。西红柿施肥的原则应遵循：以基肥为主，追肥为辅；以重施优质腐熟有机肥为主，无机肥为辅。
因西红柿要求土壤条件较高，因此，为了给西红柿提供更全面的营养，在全生育期都可增施金宝贝微生物菌肥，再结合金宝贝肥料发酵剂发酵腐熟的机肥效果更好。金宝贝菌肥既可做基肥，也可做追肥，由于金宝贝微生物菌肥中含有大量的有益菌，菌肥施入土壤后，有益微生物迅速在土壤中以几何级数繁衍扩散，以及功能微生物的代谢产物，能改善土壤的理化性状，提高亲水性、吸附性，增强通透性和保水保肥能力，金宝贝菌肥不仅含有大量固氮、解磷、解钾活性菌，还含有腐殖酸、有机质和多种微量元素，从而可使番茄增产增收，并有提高品质的效果。
经过实践证明，金宝贝微生物菌肥应用在西红柿上具有以下几具显著优点：
（1）可有效预防番茄青皮果、裂果，使西红柿着色更均匀，畸形果少，口感好，肉质厚，耐贮运，商品性好。
（2）能促进番茄植株生长，叶色深绿，苗齐苗壮；
（3）还能降低茎基腐病、溃疡病、疫病、晚疫病、灰霉病等番茄常见病害的发病率，另外南京博士邦农药杀菌剂嘧霉百菌清，异菌脲防治灰霉病效果好。
（4）能提高番茄的产量，还可提早成熟，增产幅度达 30％以上，增产效果十分明显。
