多菌灵是一种广谱性内吸杀菌剂，能被植物的种子、根和叶吸收，可在植物组织内输导。化学性质稳定，可与一般杀菌剂或者生长调节剂、叶面肥混用，但与杀虫剂、杀螨剂混用时要随混随用。因为多菌灵遇到碱性物质容易分解，所以不能与石硫合剂、波尔多液以及其他铜制剂混用，以免降低药效或产生药害。
多菌灵属于特别容易产生抗性的杀菌剂之一，长期单一使用容易使病菌产生抗药性，应与其他杀菌剂轮换使用或混合使用。甲基硫菌灵与多菌灵属同一类药剂，所以不宜用它作为与多菌灵轮换使用的药剂。土壤处理时，有时会被土壤微生物分解，降低药效。如土壤处理效果不理想，可改用其他使用方法。安全间隔期15天。
多菌灵正确使用方法要根据针对的作物来定：
一、防治果树病害：
1、在梨树萌芽期和谢花后，用50%可湿性粉剂500倍液各喷雾1次，以后每隔7-10天喷1次，连续2-3次，可防治梨黑星病。
2、用50%可湿性粉剂500-800倍液，从苹果发病初期开始喷雾防治，7-10天后再喷1次，可防治苹果褐斑病。
3、从葡萄展叶后到果实着色前，每隔10-15天用50%可湿性粉剂500-1000倍液喷雾，对葡萄黑痘病、白腐病、炭疽病，防治效果良好。
二、防治蔬菜病害：
1、从病害初发期开始，用50%可湿性粉剂800-1000倍液，每隔7-10天喷雾防治1次，连喷3-5次，可防治番茄早疫病、瓜类白粉病、甜菜褐斑病。
2、黄瓜、西瓜等瓜类移栽定植前，每亩用50%可湿性粉剂1-1.5公斤，加细土25-30公斤拌匀，均匀地撒在定植沟或穴内，结瓜期再用50%可湿性粉剂1000倍液灌根，可防治瓜类枯萎病。
三、防治棉花病害：用50%可湿性粉剂1公斤，对水10-20公斤，拌棉种100公斤，堆闷6小时后播种，或用50%可湿性粉剂250倍液浸种24小时，晾干播种，可防治棉苗立枯病、炭疽病。
四、防治花生病害：用50%可湿性粉剂0.5-1公斤，花生种100公斤，拌匀后播种，可防治花生黑斑病、茎腐病等。
五、防治小麦赤霉病：小麦抽穗盛期，用50%可湿性粉剂500-1000倍液喷雾，隔5-7天再喷1次。每次每亩喷药液75-100公斤。
六、防治水稻纹枯病：用50%可湿性粉剂500-1000倍液，在水稻分蘖末期和孕穗期各喷雾防治1次。
七、防治地瓜黑斑病：移栽前，用50%可湿性粉剂3000-4000倍液，浸渍地瓜苗茎基部5分钟。
八、防治花卉病害：根据发病情况，用50%可湿性粉剂500-1000倍液喷雾，可防治各种花卉的白粉病以及月季褐斑病，君子兰叶斑病，兰花炭疽病、叶斑病等。
