微生物肥料是通过特定微生物的生命活动,增加植物的营养或产生植物生长激素,促进植物生长的一种制品,是农业生产中使用肥料的一种。施用微生物肥料,就是通过人工接种的方法,把微生物肥料中大量有益微生物加入到农作物根际和土壤中,通过它们的代谢活动来提高土壤肥力,刺激作物生长和抑制有害微生物的活力。因此,微生物肥料主要是依靠活体微生物菌体才能发挥作用,其中有效活菌的数量是微生物肥料质量的重要标准之一,该类肥料在农业部登记,必须符合农业部相关质量标准。
目前微生物肥料分为微生物菌剂、复合微生物肥料和生物有机肥3类:
一、微生物菌剂:是指目标微生物(有效菌)经过工业化生产扩繁后加工制成的活菌制剂。它具有直接或间接改良土壤、恢复地力,维持根际微生物区系平衡,降解有毒、有害物质等作用。按内含的微生物种类或功能特性分为根瘤菌剂、固氮菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐类微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂等；产品剂型分为液体、粉剂和颗粒型；
二、复合微生物肥料:是指特定微生物与营养成分复合而成,能提供、保持或改善植物营养,提高农产品产量或改善农产品品质的活体微生物制品；
三、生物有机肥:是指特定功能微生物与主要以动植物残体(如畜禽粪便、农作物秸秆等)为来源并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。
