中耕管理主要包括中耕锄草、揭膜、提沟培土和封顶抹杈等技术措施。中耕管理的最终目标要达到田间烟株长势整齐一致，垄无杂草，沟无积水，烟株清秀无病。
1、中耕除草
没有覆盖地膜的烟田至少要进行三次中耕。第一次中耕在移栽后7-10天进行，以疏松表土层，消灭杂草为目的，要浅锄、碎锄；第二次是移栽后20天左右结合小培土进行。以疏松根际土壤，促进根系生长为目的。要做到烟株近处浅锄，远处深锄，深度为10厘米左右，用细土壅根，促进根系增长；第三次是移栽后30-35天进行，要做到深提沟，高培土。地烟培土高度在30厘米以上，田烟40厘米以上。同时要清理排灌沟渠，便于后期排水防涝，减少病虫害。
2、揭膜提沟培土
对于地膜覆盖的烟田，第一、二次中耕可不进行。但要在适当的时机进行接膜提沟培土。一般在移栽后35-45天，烟株高度为20-25厘米是揭膜的最佳时机。接膜后直接按第三次中耕的要求进行提沟培土，要做到垄体充实饱满，沟线平直无杂草。揭下的残膜要全部清除烟田，集中处理。
3、封顶抹杈
移栽后50天左右，烟株从营养生长转入生殖生长，开始现蕾开花，这时就需要进行封顶抹杈。封顶抹杈可以减少烟株生殖生长对养分的消耗，确保烟叶中养分的积累，提高烟叶产量和质量。
一般情况下，当一块烟地中有50%的烟株达到中心开第一朵花时，是进行封顶的最好时期。但针对不同的烟株长势，可适当提前和延后封顶的时间。生长弱的烟株，可在现蕾时就进行封顶，保证充分的养分供叶片的生长；对于生长过旺的烟株，可在盛花期封顶，以便消耗一些过剩的养分。
封顶一般从花下第三个叶片封起，结合清除无使用价值的底脚叶，留叶数控制在18-22片。
4、化学抑芽
烟株封顶时，叶芽也会大量出现。它也会消耗烟株的营养，所以要抑制它的生长。目前大多采用化学抑芽。常用的药物抑芽剂有抑芽敏、止芽素等。操作方法是封顶的同时把长度2.5厘米以上的叶芽全部抹去，根据不同抑芽剂的使用说明，采用喷洒、杯淋等方法进行施药。施药时要确保烟株顶端五片叶的叶芽处都淋到药。要求当天封顶当天施药，这样才能保证良好的抑芽效果。施药后5-7天内进行一次检查，对漏淋和抑芽效果不好的烟株再补施一次。
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