缩二脲的坏处有很多，对作物生长影响较大，容易导致烧根、烧苗，造成不少伤害。
缩二脲是尿素分子在高温化学反应中生成的物质，又称双缩脲，对种子的发芽和作物的生长均有害。据了解，当肥料中缩二脲含量高于0.5%时，不可作根外追肥施用，否则容易烧苗。业内专家指出，只要以尿素为原材料，通过高温(高于130℃)生产的复合肥均有可能产生缩二脲。
缩二脲会抑制和伤害幼苗的毛细根，即使成龄果树的毛细根同样也会受到伤害，同时也减少作物对肥料的吸收。
目前，国内复合肥生产技术主要有高塔造粒、滚筒造粒、氨化造粒等，其反应温度均在130℃以上，通常选择尿素作为氮源，经过高温造粒生产各种复合肥。一旦生产工艺波动或是控制不当，肥料中缩二脲的含量就会偏高，生产的产品易造成肥害。因此，缩二脲含量超标等问题一直困扰着肥料生产企业。
近年来，肥料中缩二脲含量偏高造成肥害的事件时有发生。目前大多以尿素为氮源的肥料多数含有缩二脲，不少肥害很可能是由于缩二脲超标导致的。
据了解，现行的复合(混)肥国家标准并不需要检测缩二脲含量，也没有规定其含量上限，只需在包装上标有是否含有缩二脲即可，这导致缩二脲成了一颗“隐形炸弹”。
不少业内人士表示，近年来各地出现的一些肥害事件，虽然抽样检测结果显示氮、磷、钾含量均合格，但实际上是肥料的缩二脲含量超标所导致。由于无需检测缩二脲，事件最后不了了之，令受害农户无从得到应有的赔偿。
对于如何彻底消除肥料中的缩二脲，华南农业大学资环学院植物营养系主任樊小林介绍，不使用尿素是最直接的办法，目前不少企业正在通过改变氮源的方式，避免在高温生产过程中产生缩二脲，但是生产成本将大幅增加。其实只要改进生产工艺，即使以尿素作为氮源生产的复合肥也不会产生缩二脲。另外，一位复合肥生产企业工作人员告诉笔者，只要温度高达135℃的尿浆在传输过程停留时间不超过10分钟，缩二脲的含量便不会太高。至于具体能够降低到多少，则需要企业自己来控制。不过，由于不需要检测，大多数企业并不愿意花费过多成本改进生产工艺或原料，以减少肥料中缩二脲的含量。
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