我国农业生产中存在着很多问题，比如化肥农药使用过量残留等，这也让国家重视起来，并提出来到2020年化肥使用零增长。化肥产品的使用过度，给微生物肥料迎来发展的黄金时机，但是推广起来仍需要时间。
中国生产了占世界总量16%的粮食，但却使用了占世界31%的化肥，如果按粮肥比例测算，化肥完全可以减半。不合理的农用化学品的投入等问题，让耕地不堪重负，土传病害增加、土壤有机质下降、酸化、板结、盐渍化和重金属超标，直接影响到了农产品安全。
此外，绝大多数农户施肥集中在基肥，追肥不足。中国农业大学资源与环境学院教授张福锁介绍，基肥的使用严重过剩也是现存的较大问题。英国农民用20年的时间，使基肥用量从90%降到了20%。我国需要更长的时间，或许是100年。
微生物肥料的黄金时机
上月农业部印发《耕地质量保护与提升行动方案》，该文件细致并深化了《到2020年化肥使用量零增长行动方案》。其中明确指出并强调要调整化肥使用结构，提高肥料利用率，发展新型肥料。
利好政策的不断出台，新型肥料迎来了发展的黄金机遇期。
微生物肥料在新型肥料中最具发展潜质。因为微生物肥料在减少化肥与农药用量、增加作物产量与提升农作物品质方面有独特的优势。
“中国比任何国家都需要发展和使用生物肥料。”农业部微生物肥料质量监督检验中心主任李俊表示，由于长期使用化肥肥料，导致农业生产出现一系列问题，加上中国耕地复种指数高和连作生产，土壤持续生产能力、肥料利用率下降，土壤质量、农产品质量安全问题日益严重，而解决这些问题，离不开微生物肥料。
微生物肥料具有“四两拨千斤”的独特功能，既能活化土壤，提升肥效，又能保障农产品质量安全，是农业可持续发展不可缺失的投入品。同样，微生物肥料功能多样，能够充当分解者（秸秆分解、土壤有毒有害物质降解）、转化者（磷、钾、钙、镁等养分的有效形态转化）、生产者（生物固氮、产生各种促生物质）等。
据数据显示，与传统肥料相比，生物肥料通过调控土壤微生物区系能够让作物增产20%，可减少20%的化肥与农药。
“微生物肥料的功能特点与国家农业可持续发展道路相吻合，是国家战略的必然选择。”李俊讲到，“其在提高肥料利用率、减少化肥用量方面将大有作为。”
业内人士表示，未来我国微生物肥料使用量能占到化肥使用量的10%，其市场容量将达到1400万吨。另外，国家将在“十三五”和更长时期支持和发展微生物肥料产业届时微生物肥料将会占肥料总量的15%左右应用推广面积4亿亩以上。
但微生物肥料仍面临问题
在业内人士的一片看好底下，微生物肥料在推广和管理上仍面临问题。毕竟目前国内的生物肥料仍不能很好地在短期内解决高产问题。再者，微生物肥料的行业管理需进一步规范，产品需要标准化。
据一些农民反映，在转用生物肥料开始的1，2年，生物肥料的前期投入是要高于化肥。按照目前市场情况，生物有机肥在每亩的投入要高于化肥约5%-10%，此外，由于生物肥料需要额外进行配肥等其他工序，用生物肥料要多出配肥人工费，再加上前期的技术不熟练而导致的损耗，额外的支出是很多的。而中国人均耕地面积少，对于很多农民来说，短期的高投入产出比仍会让农民较难取舍化肥。
通过与农村合作社等多方位的向农民推广，以及在技术上根本解决高效问题（解决生物肥料能高效固氮、高效解钾、高效溶融磷、高效促生），将会是未来的重中之重。
同时，尽管农业部于1996年开始将微生物肥料纳入肥料登记的管理范畴，规定微生物肥料必须在农业部进行检验登记，而当中的管理条例也在不断深化。但在真正实施过程中，许多产品仍出现不进行登记，诸如知识产权、“保密”等，使一些有问题或质量不合格的产品堂而皇之地进入市场。这些状况不仅不利于生产和产品质量的提高，对本领域的产业化也是一个严重的障碍。
规模化、标准化生产微生物肥料，这样才是解决功能菌种、生产工艺、提高产品质量、降低生产成本、稳定应用效果等方面的根本途径。
