废弃物制成肥料是好事，但当前发展面临诸多难题。具体难在哪儿？
来自农业部的最新统计，农业已经超越工业成为中国最大面积的污染产业，农业面源污染已经成为中国农业生产和农业可持续发展的严峻挑战。
据南京林业大学教授周建斌介绍，中国水污染、空气污染、土壤、食品安全面临的问题不容忽视：肥料过量导致水质污染问题严重；土壤有机质含量降低；土壤酸化问题严重；土壤污染加重，食品安全堪忧；巢湖、太湖等水污染的重要污染源，农业上化肥和化学农药的过量使用。
面对发展废弃物肥料面临的困惑，江苏省农委耕地质量保护站推广研究员黄彬总结为“四个困惑”：
一是产品质量不过关。废弃物肥料生产与其他肥料生产一样，都要经过科学加工，最基本的质量要求应做到“无害、达标、有效”。而不少企业产品质量有问题，如人畜禽粪便发酵不到位，秸秆腐熟剂施后秸秆不能如期腐熟，无机废弃物有害物质超标、或者有效养分含量不达标、或者养分利用率极差等等。
二是农化服务跟不上。好肥料实现好效果就必须科学施用。否则，直接影响产品的推广销售。有些企业产品质量不错因售后农化服务跟不上，农民使用方法不当，肥效不能预期发挥，用户自然不接受。事实证明，农化服务好的肥料市场竞争力强，好推广。废弃物肥料也是新肥料，加之，废弃物生产的肥料，农化服务水平要求更高。
三是监管体系不到位。一方面该管的不管，不该管的管了。政府相关主管部门人为定了许多条条框框，导致可利用的废弃原料不准用，可快速投放市场的产品而延缓上市，具备生产条件而没有某项指定设备就不准生产等，使很多肥料企业丧失信心，阻碍和影响废弃物肥料的快速推广。一方面该推的不推，不该推的推了。全国测土配方施肥技术已推广10多年，等比例、高含量的氮、磷、钾复混肥仍然占主导市场，功能性、绿色化的废弃物系列肥料占比甚微。一方面该研发的不研发，不该研发的研发了。主管部门应该研发可信度高、稳定性强、普及性好的检测仪器和方法，确保公平、公正、公开的评判废弃物肥料产品的质量和推广价值，而目前恰恰暴露出这方面管理的弱项。
四是政策扶持不落实。废弃物肥料是低能耗、无害化的变废为宝，是减量化、优质肥料化的生态环保，是低成本、高效益的新型肥料，政府投资反而极少。同时，已投资的该相关项目，在投资效益上还有很大的提升空间，如植物秸秆肥料化处理不能仅靠目前招标的“秸秆腐熟剂”。
