马铃薯施肥以基肥为主，一般占总用肥量的60%～70%。结合整地或覆土时施入，播种后亩用2000～2500公斤有机肥盖种，再用150公斤稻草覆盖。3天后把总施肥量50%的氮肥、40%的钾肥和100%的磷肥施入，同时亩施2公斤硫黄。以条施为主，随即覆土。用有机肥和稻草覆盖，增加土壤透气性，且结出的薯块表皮光滑，有光泽，提高商品性，稻草腐烂后又可增加土壤有机质含量。
氮肥追肥不宜过迟，尤其在后期，以避免茎叶徒长。中后期钾肥为主，可分2～3次施用，齐苗时第一次追肥，促早发，增加光合作用。此时氮肥占总施氮量的30%，钾肥占总施钾量的20%，对水浇施，沟底留有浅水层，施后立即排水。现蕾时第二次追肥，促茎叶持续生长，增加光合作用，利于块茎膨大。此次追肥一般施入总施氮量的20%，总施钾量的40%。宜在下午进行，避免叶片沾上肥料，肥料撒施后立即浇水以加速溶解，兼顾清洗叶片。后期增施钾肥可增产3%～6%，且商品正品率提高2%～3%。以后看苗施肥，苗势差的每亩补施4～5公斤优质复合肥。
马铃薯对钙、镁、硫等中、微量元素要求较大，可结合病虫害防治根外追肥，亩用高乐叶面肥200克400倍液喷施，前期用高氮型，提高光合作用效率，后期距收获期40天时，采用高钾型，每7～10天喷一次，以防早衰，加速淀粉的累积。
氮肥以尿素为主，磷肥以过磷酸钙为宜，钾肥用氯化钾，三种肥料可混施入畦中。第一次追肥可采用碳酸氢铵加过磷酸钙对水浇施，碳铵要充分溶解，以免桶底肥液浓度过高灼伤叶片。中后期多采用尿素、氯化钾或进口复合肥混施。氮∶磷∶钾比例16∶16∶16的复合肥成本高、磷素含量过高，造成浪费，且污染环境。团棵期、现蕾期喷施锰、锌、铁肥，防止叶片黄化。如土壤中有缺硼现象，可用0.1%的硼砂溶液浸块茎。
