一，海藻肥对作物的作用机理
由于海藻生长在海水中，所以特殊的生长环境使海藻除了陆地植物所具有的化学成分之外面还含有许多陆地植物不可比拟的多种营养物质，如海藻多糖、甘露醇、酚类多聚物、甜菜碱、褐藻糖胶。另外、海藻肥中还有大量的吲哚乙酸、脱落酸、细胞激动素、苏霉素等植物生长活性物质和碘、钾、镁、锰、钛等矿物质微量元素。
海藻中的海藻多糖、酚类多聚物、甜菜碱，具有促进植物体内有机物和无机物的上下输送导向、调节细胞渗透的作用，能促进作物生长，诱发作物产生抗逆因子，提高作物机体免疫力的活性，增强作物抗病性，对植物体内的一系列酶有保护作用。海藻中的褐藻糖胶具有抗病毒、抗氧化的作用，可提高作物免疫系统功能，调节和增强作物免疫力，阻止作物对重金属及其他毒素的吸收。海藻中的甘露醇具有参与集体光合作用、调节集体营养渗透平衡的作用，能迅速修复、愈合伤口，疏通作物受阻微管束。海藻中的酚类多聚物、甜菜碱还具有吸虫和抗真菌等功能。
海藻中的内院激素细胞激动素，能促进细胞分裂、细胞体扩大，能打破种子休眠并促其萌发，能促进侧芽生长和抑制作物衰老。海藻中还含有赤霉素基吲哚乙酸、吲哚丁酸等生长素，可打破种子休眠，促进作物生长，诱导作物开花，同时，也能促进木质部、韧皮不细胞分化，刺激新根的形成，促进插条发根。
二，海藻肥对土壤的作用机理
土壤中缺乏有机质，不但使土壤中微生物菌群的繁殖和生长受到抑制，所施肥料中的氮、钾、磷、钾等营养物质不能被分解成作物能够吸收的营养，造成肥料的及大浪费，而且减少土壤有机胶体，造成土壤板结，甚至盐泽化。
海藻肥有机活性物质非常丰富，施肥有机质含量大于18%，使土壤结构形成团粒结构，透气、保水，提高低温，非常有利于微生物菌群的繁殖和生长，这些微生物可在植物、微生物代谢循环中起到催化剂的作用，使土壤的生物效力增加，同时有机质的分解机土壤微生物的代谢物可为植物提供更多的养分。
海藻肥中含有的海藻酸是天然土壤调理物质，促进土壤团粒结构的形成，可增加土壤生物活力，内含的活性酶类可增加中的有益微生物，具有改良土壤、增加土壤肥力的作用，减轻农药、化肥等有害物质对土壤的污染。
海藻肥含有的天然化合物如海藻酸钠，是天然土壤调理剂，有利于形成水稳性团粒结构不可缺少的胶结物质，促进，改良土壤团粒结构，有助于黏性土形成良好的结构，改善土壤内部孔隙空间，恢复由于土壤负担过重和化学污染而失去的天然胶质平衡，增加土壤生物活力，促进速效养分的释放，提高土壤保肥、蓄水的能力，也能提高土壤对酸碱的缓冲性。同时，也有利于作物根系生长和提高的抗逆性。
因此，海藻肥不仅可以分作物生长提供丰富的营养，促进作物的增产，还可在提高土壤保水、保肥能力，减少养分流失，减少化肥用量，提高用量，提高化肥利用率等方面发挥十分显著的作用。
