1、番茄日灼
症状：果实向阳面呈有光泽、似透明的薄纸状，后变黄褐色斑块，有的出现皱纹干缩变硬而凹陷，果肉变成褐色、块状；当日灼部位受病菌浸染或寄生时，长出黑霉或腐烂。
病因：天气干旱，土壤缺肥，处在转色期前后的果实，受强烈日光照射，致使向阳果面温度过高而引起灼伤。
防治措施：增施有机肥，增强土壤保水力。在绑蔓时应把果实隐蔽在叶片间，减弱阳光直射；摘心时，要在最顶花序上面留2－3片叶子，以利覆盖果实，减少灼伤。
2、番茄空洞果
症状：空洞果是指果皮与果肉胶状物之间是空洞的果实。从外表面看空洞果，横断面大多呈多角型，切开果实后可以看到胎座发育不良，果皮隔层很薄看不见种子。
病因：大棚容易出现高温危害，使花粉不稳，受精不良，种子形成少，致使胎座组织的发育赶不上果皮部的发育而产生空洞果，由于种子形成的少，便会缺少大量的果胶物质充实果腔，引起果实空洞；此外，使用生长素2，4－D或番茄灵蘸花防止落花时，如果处理时间过早，浓度太大也会影响种子形成。在高温条件下，生长素过强，种子也少，同样会导致空洞果的产生，氮素肥料施用过多，空洞果的发生也多。需肥量大的品种，生长后期营养跟不上，炭水化合物积累少，也会出现空洞果。
防治方法：采用配方施肥技术，合理分配氮、磷、钾，使植株营养生长与生殖生长相协调；正确使用生长调节剂，掌握处理花朵的时间和浓度，蘸花时，必须是花瓣已经伸长到喇叭口状的花；温度要适宜，第一花穗花芽分化前后，要通过调温，避免持续10℃以下的低温出现，开花期要避免35℃以上高温对受精危害，促进胎座部的正常发育。
3、番茄畸形果
症状：番茄在低温、光照不足、肥水管理不善、植物生长调节剂使用不当时，根冠比失调，花器和果实不能充分发育，出现尖顶果、突指果、大脐果、椭圆形果，养分过多集中输送到正在分化的花芽中，致使花芽细胞分裂过旺，心皮数目增多，从而形成多心室的畸形果。
病因：番茄花芽分化及在花芽发育时遇到5－6℃持续性低温，加上灌水多，抑制幼苗的营养生长，偏施氮肥，花芽过度分化，形成多心皮畸形果，果实呈桃形瘤形或指形等，如苗龄拉长，低温或干旱持续时间长，幼苗处在抑制生长条件下，花期易木栓化，后转入适宜条件，木栓组织不能适应内部叶肉细胞的迅速生长，则形成裂果、疤果或籽外露果。
防治方法：育苗时花芽分化前后要加强管理，避免苗期持续性低温，夜温要在8℃以上，至少应避免连续多天和长时间5℃以下低温；注意施肥，避免肥料尤其是氮肥施用量过多，同时要避免苗床过于潮湿，各个花序的第一朵花容易产生鬼花（又叫重合花，即花朵比一般的萼片、花瓣数量多，心皮也多，往往是几个花芽重合在一起而形成的花）应疏掉；合理使用生长调节剂，幼苗出现徒长时，勿过分降温、控水，喷施85%B9可溶性粉剂2000倍，这样既可提高幼果质量，又不影响花芽分化。
4、番茄脐腐果
症状：本病多发于果实迅速膨大期的幼果上，发病初期在幼果脐部出现水浸状斑，后逐渐扩大，至果实顶部凹陷、变褐且变硬。严重时病斑可以扩大到半个果面，湿度大时腐生黑色霉状物。
病因：果实膨大期，水分供应不均衡，干旱情况下，番茄叶片蒸腾消耗大量的水分，果实内，果脐部争夺不到水分使其生长发育受阻，形成脐腐；另一原因是果实缺钙（0.15%－0.20%以下）造成的，由于钙被植物吸收固定以后不易向其他部位转移，如果土壤中钙的绝对量不足，或高地温和土壤干燥钙离子不能被吸收，则根系不能继续吸收钙，细胞间膜会发生崩结，使细胞相互分离而组织坏死，造成脐腐病发生。
防治方法：酸性土壤可施用适量的过磷酸钙，使土壤呈中性；避免施用过多的速效性氮肥，否则会阻碍钙的吸收；灌水要均匀，时间在上午进行，经常保持土壤湿润；根外追施钙肥，番茄座果后1个月内是吸收钙的关键时期，可喷洒1%的硝酸钙及，从初期开始，隔10天喷一次，连续喷洒三次。
5、番茄筋腐病
症状：有两种，一种是褐变筋腐病，一种是白变筋腐病。褐变筋腐病的症状是在果实转色期，果面不转红，凹凸不平，或果面局部变褐，切开果实可见果皮内的维管束出现变褐坏死，或出现黑色糠心，或胎座组织变褐；白变筋腐病多发于果皮内胎座组织上，症部呈腊样的光泽、质硬，果肉似白色“糠心”状，果实着色不良。
病因：筋腐病的发生主要是由内外多种因素综合影响造成，外部因素有：土壤缺钾，氮肥过多，尤其是硝胎氮肥多，土壤前期低温，湿度过大，土壤板结；内部因素有：植株生长势弱，根系吸收养分少，加之不适整枝方式破坏平衡各序花座果率低，光合速率低，造成叶绿素形成受阻，碳/氮比例失调，可溶性固形物含量减少，褐变物质聚集形成筋腐病。
防治方法：首先选择无限生长型果皮较厚的品种，前期注意多层覆盖，防止夜温过低；膜下铺设滴灌带，防止湿度过大；低施磷、钾肥，开花、结果盛期追施钾肥；整枝时不要强摘心；增大叶面积，充分增加光照。
6、番茄生理性卷叶病
症状：番茄采收前或采收期，第一果枝叶片稍卷，或全株叶片呈筒状，卷叶较轻时，植株的光合效率低，果实变小，产量下降。卷叶严重时，会导致植株正常生理代谢失调，座果率降低，果实畸形。
病因：一是施肥不当造成。土壤中氨态氮较多时，根部吸收的氮肥转化成氨基酸，其中一部分氨基酸转化成植株生长激素，在顶部幼叶中积累，促使叶面加速生长，造成卷叶，或是土壤中缺乏植株生长所必需的微量元素，如缺硼，会使茎基部疏导组织坏死，茎尖停止生长，顶枝卷曲；缺铜叶片呈深蓝绿色，且卷曲；缺锌，叶柄向后卷曲；缺钼，叶片上卷，叶尖萎蔫。二是植物激素使用不当。为促进开花和座果，生产上常采用蘸花或喷雾的方法使用激素，由花吸收的生长刺激素积累在生长点里，如果大量积累，幼嫩叶片就会出现萎缩卷曲。因此，大棚栽培的番茄如果遇到连阴雨天，日照不足，薄膜透光不好，或是使用激素浓度过高，都容易出现叶片生理卷曲现象。三是高温干旱、灌水不当造成。四是摘心过早，整枝不当造成。
防治方法：采取测土施肥方法，肥料要搭配使用；整枝摘心选择晴天上午10时至下午2时温度较高时进行，雨天不可摘心；合理使用植物生长调节剂；天气干旱，可3－5天灌1次水，防止土壤过干。
