水稻土是一种不同于旱作各种土壤的特殊土壤类型。它是在人为耕作施肥条件下形成的，人为因素占主导地位。它常年或季节性淹水，导致了特有的物理和化学性质。因此磷素及磷肥的水稻土中的转化也完全不同于旱作。磷肥在水稻土中的形态转化情况如下。
一，水溶性和枸溶性磷肥在水稻中的转化 我国常用的水溶性磷肥是过磷酸钙，其主要是磷的形态是磷酸一钙。我国最主要是枸溶性磷肥是钙镁磷肥，它是一种玻璃体。
过磷酸钙施入水稻土后，有效磷迅速下降，半年以后，大体上保持在一个稳定的水平上，而钙镁磷肥施入土壤后，有效磷水平开始（半年内）有一个提高过程随后有所下降，一年后又一定上升。但在半年以后，钙镁磷肥保持的有效磷水平均高于过磷酸钙。
二，难溶性磷肥 通常所说的难溶性磷肥是指直接施用的磷矿粉。当前强调施肥不破坏环境的前提下，磷矿粉被看做一种“缓释”肥料。它不以造成环境问题。所以提倡施用磷矿粉的呼声近年又从各地响起。但是磷矿粉用于水稻土有其不利的当面，因为磷矿粉常常需要依靠土壤酸性来活化其磷素，但在水稻土的情况下，即使原来的酸性的土壤上，淹水之后也转变为中性了。水稻土的这一特性不利于磷矿粉中磷的活化。
三，结晶态分红磷铁矿在水稻土中的转化 国内外的研究都证明，在中性和酸性水稻土中，磷主要以Fe-P形态存在。有结果表明我国水稻土中Fe-P含量远大于Al-P和Ca-P,占非闭蓄态磷的58%--76%。
酸性土壤中存在着结晶的和无定性的磷酸铁，他们在性质上和有效性方面都是不相同的。两种磷酸铁在不同pH时溶解度的巨大差异，在pH5以下和pH6以上时，无定型磷酸铁的溶解度大大高于结晶态磷酸铁。将这两种磷酸铁与土壤混合并在湿润条件培育一个月后，无定型磷酸铁的溶解曲线向结晶态靠近。这可能意味着无定型磷酸铁的结晶化趋向，但是，把两种磷酸铁盐加入土壤中并淹水培育一个月后，两者的溶解曲线即大体重合，重合后的溶解曲线和无定型磷酸铁更为接近。
